1.胚胎质量。试管婴儿胚胎移植成功后，胚胎发育过程中的“消亡”和“自然选择”都与其本身质量有莫大的关系，尤其是胚胎染色体异常情况，更会加重胚胎后期的自然流产风险。双胎妊娠却只能有一胎存活，存活的一定是具备发育潜能的优质胚胎。
2.双胎输血综合症(TTTs)。TTTs绝大多发*在双羊膜囊单绒毛膜双胎(MCT)，MCT胎盘存在表层以及深层血管吻合。深部的动静脉吻合往往呈单向血流，即在单位时间内甲胎儿流向乙胎儿的血流量多于乙胎儿流向甲胎儿的血流量，甲胎儿成为供血者，乙胎儿成为受血者。供血胎儿由于不断向受血胎儿输血，造成贫血、发育迟缓、甚至死亡。而受血胎儿由于高血容量，尿量增加引起羊水增加，红细胞增多，容易出现水肿。这是双胎妊娠中一种较为严重的并发症。其治疗方法主要有胎儿镜下选择性激光电凝治疗、羊水减量、羊膜造口等。
如果内心过度紧张容易引起内分泌失调，内体一系列的负面因子产*，从而导致胚胎难以着床，因此，不孕妇女在试管婴儿治疗过程中保持乐观豁达的心理至关重要。
